APC-3.1.6導入し様子を見ていると
一部の分部で障害が発生してる事を判明しました
障害対象方法を記入する事にします

障害①
apache の エラーログに以下のエラーが出力されてました。
エラーログ
child pid 12629 exit signal Segmentation fault (11)
解決方法
ZendOptimizerAPC を併用して使用すると出力されます。
また、ZendOptimizer の設定を解除すると解決します
設定内容
zend_extension_manager.optimizer=/usr/local/Zend/lib/Optimizer-3.3.3
zend_extension_manager.optimizer_ts=/usr/local/Zend/lib/Optimizer_TS-3.3.3
zend_optimizer.version=3.3.3
zend_extension=/usr/local/Zend/lib/ZendExtensionManager.so
zend_extension_ts=/usr/local/Zend/lib/ZendExtensionManager_TS.so

php.ini より、上記の設定内容削除すると解決します

障害②
Zen Cartログイン画面より、ログインする事が不可能になる
APCログイン画面の内容を キャッシュ情報保存する為に
ログインする事が不可能になるみたいです
解決方法
Zen Cartadmin フォルダ配下の .htaccess に、以下の内容を追加する。
追加内容
php_flag apc.cache_by_default off 
上記内容を追加後、 apache再起動すると ログインする事が
可能になりました